- Casa Branca
- Porto Campanhã
- Vilar Formoso
- Porto São Bento
- Aveiro docks branch
- Sernada do Vouga
- Aveiro docks branch
- Sernada do Vouga
- Fundão
- Covilhã
- Belver
- Vilar Formoso
- Tomar
- Belver
- Lagos
- Covilhã
- Tomar
- Tunes
- Tomar
- Porto Campanhã
- Porto Campanhã
- Ródão paper mill
- Entroncamento
- Vila Nova da Baronia
- Tua
- Belver
- Poceirão
- Aveiro
- Setúbal
- Entroncamento
- Entroncamento container terminal
- Porto São Bento
- Entroncamento
- Coimbra
- Setúbal
- Verride
- Pocinho
- Castelo Branco
- Poceirão
- Belver
- Alfarelos
- Beja
- Amieira
- Setubal
- Bombarral
- Alcacer do Sal
- Tua
- Setúbal
- Siderurgia steelworks branch
- Caldas da Rainha
- Ródão paper mill branch
- Setúbal
- Setúbal
- Alcacer do Sal
- Bombarral
- Pocinho
- Tua
- Lagos
- Caldas da Rainha
- Leiria
- Porto São Bento
- Barriero
- Évora
- Ermidas-Sado
- Alfarelos
- Setúbal
- Régua
- Alcantarilha
- Pocinho
- Tunes
- Canal-Caveira
- Setubal
- Canal-Caveira
- Ermidas-Sado
- Casa Branca
- Tunes
- Lagos
- Grândola